중도 입사자 연말정산, 종전 근무지 원천징수영수증은 2월 급여 전에 받습니다

한국에서 연도 중에 직장을 옮기거나, 회사가 연도 중에 직원을 뽑고 내보내면 연말정산이 두 번 돕니다. 연말정산은 회사가 직원의 1년치 근로소득세를 다시 계산하는 절차입니다. 이 글은 외국인 직원, 외국인 창업자·경영자, 급여 담당자를 위한 안내입니다. 요약하면 이렇습니다. 종전 회사는 퇴사자를 정산하고 원천징수영수증을 발급합니다. 새 회사는 2월 급여 전에 두 소득을 합산합니다. 합산하지 못하면 직원이 5월에 세금을 신고합니다.

연중 이직이 있으면 연말정산은 두 번 돕니다

소득세법 제137조 제1항은 연말정산 시점을 둘로 나눕니다. 재직자는 다음 연도 2월분 근로소득을 지급할 때 정산합니다. 퇴직자는 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때 정산하며, 정산 기간은 1월 1일부터 퇴직한 날까지입니다.

같은 해에 퇴사자와 입사자가 모두 있는 회사는 종전 근무지와 새 근무지 두 역할을 함께 맡습니다. 역할마다 의무와 기한이 다릅니다.

직원이 나갈 때, 퇴사월 정산과 영수증

퇴사자 정산은 연말정산과 같은 산식으로 합니다. 공제 자료를 받지 못한 채 정산하면 공제가 거의 빠집니다. 제137조 제3항은 공제신고서를 내지 않은 근로소득자에게 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용하라고 정합니다.

제140조 제1항 괄호는 퇴직한 경우 퇴직한 날이 속하는 달의 근로소득을 받기 전에 공제신고서를 내라고 정합니다. 그러니 마지막 급여일 전에 안내합니다.

퇴사 처리 때 챙길 항목입니다.

• 퇴사월 급여 지급일 전에 공제신고서 제출 안내
• 1월부터 퇴사일까지 지급한 근로소득 합계 확인
• 이미 원천징수한 월별 간이세액 합계 확인
• 정산 결과 환급 또는 추가 징수 금액 확정
• 퇴사월 급여명세서에 정산 결과 반영
• 다음 달 10일 원천징수이행상황신고서에 반영
• 원천징수영수증을 다음 달 말일까지 발급
• 회사 메일 대신 개인 메일 등 퇴사 후에도 받을 수 있는 경로로 전달

현행 제143조 제1항 단서는 영수증 발급 기한을 퇴직한 날이 속하는 달의 근로소득 지급일이 속하는 달의 다음 달 말일로 정합니다. 예를 들어 10월 31일에 퇴사하고 그 달 급여를 11월 10일에 지급했다면, 지급일이 속한 11월의 다음 달인 12월 31일이 기한입니다.

권고사직으로 퇴사했다면 권고사직 이직확인서 안내도 함께 보세요.

직원이 들어올 때, 종전 근무지 소득을 합산합니다

제138조 제1항에 따라, 과세기간 중에 퇴직하고 새 근무지에 취직한 사람이 종전 근무지 소득을 포함해 공제신고서를 내면 새 근무지가 두 소득을 더해 정산합니다. 1월부터 종전 근무지 퇴직월까지 받은 근로소득이 대상입니다.

합산하려면 종전 근무지 원천징수영수증이 필요합니다. 입사 서류를 받을 때 같이 요청해 두면 1월에 쫓기지 않습니다.

• 입사 서류 목록에 종전 근무지 원천징수영수증 추가
• 같은 해 1월 이후 근무 이력이 있는지 입사 시 확인
• 한 해에 두 번 이상 이직했다면 종전 근무지 영수증 전부 수령(제138조 제2항)
• 종전 근무지 총급여와 기납부세액 금액 대조
• 공제신고서에 종전 근무지 소득 포함 여부 확인
• 2월 급여 전 정산 마감일을 입사자에게 따로 공지

영수증을 받지 못한 직원은 새 근무지 소득만으로 정산합니다. 직원이 종전 회사와 연락이 닿지 않으면 방법이 하나 남습니다. 근로소득 지급명세서 제출기한(다음 연도 3월 10일) 뒤에 홈택스(국세청 누리집)에서 지급명세서를 조회하는 것입니다. 이때는 회사 연말정산에 늦으므로 5월 신고로 넘어갑니다.

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합산하지 못하면, 5월 종합소득세 신고

근로소득만 있는 사람은 원래 종합소득세 확정신고를 하지 않아도 됩니다(제73조 제1항 제1호). 그러나 같은 조 제2항은 2명 이상에게서 근로소득을 받은 사람에게 이 면제를 적용하지 않습니다. 제138조에 따른 합산 정산으로 더 낼 세액이 없어진 경우만 예외입니다.

그래서 종전 근무지 소득을 합산하지 못한 직원은 다음 연도 5월 1일부터 5월 31일까지 종합소득 과세표준 확정신고를 해야 합니다(제70조 제1항). 회사는 2월 정산 결과를 줄 때 이 사실을 함께 알려 주는 편이 좋습니다. 두 곳의 소득을 더하면 합계 금액에 누진세율이 다시 적용되어 추가 납부가 생길 수 있습니다.

동시에 두 곳에서 일하는 경우

이직이 아니라 같은 기간 두 회사에서 근로소득을 받는 경우는 제137조의2가 적용됩니다. 주된 근무지와 종된 근무지를 정하고, 종된 근무지 원천징수영수증을 2월분 급여 전에 주된 근무지에 내면 주된 근무지가 합산해 정산합니다. 종된 근무지는 요청을 받으면 영수증을 지체 없이 발급해야 합니다(제143조 제2항). 어느 쪽으로도 합산하지 못하면 제73조 제2항에 따라 5월 확정신고를 합니다.

2월 정산 이후 남는 일

• 추가 납부세액이 10만원을 넘으면 2월분부터 4월분 급여까지 나눠 징수할 수 있습니다(제137조 제4항).
• 징수할 세액이 그 달 급여보다 크면 다음 달 급여에서 이어서 징수합니다(제139조).
• 근로소득 지급명세서는 다음 연도 3월 10일까지 제출합니다(제164조 제1항).
• 폐업·해산하면 지급명세서 기한이 폐업일 등이 속하는 달의 다음다음 달 말일로 당겨집니다(같은 항 괄호).
• 반기납부 승인 사업장은 원천세를 반기 마지막 달의 다음 달 10일까지 납부합니다(제128조 제2항). 자세한 내용은 원천세 반기납부를 보세요.

체크리스트

• 퇴사자 정산: 퇴사월 급여 지급 시, 1월~퇴사일
• 공제신고서를 내지 않은 퇴사자: 본인 기본공제와 표준세액공제만
• 퇴사자 영수증: 퇴사월 급여 지급일이 속하는 달의 다음 달 말일까지
• 입사자 합산: 종전 근무지 영수증을 2월분 급여 전에 받아 합산
• 합산 실패: 직원이 다음 연도 5월 확정신고
• 지급명세서: 다음 연도 3월 10일